1．从性能上对比，水性漆的成分是合成树脂和水性溶剂。木蜡油则集合了数种油和蜡的优点而成，因此从渗透性来说木蜡油是最好的。
2．涂刷后木材的纹理得以突显，而水性漆都有表层漆膜纹理，故而会略显模糊。耐水性，耐污性方面由于目前的水性漆性能还未臻完善，遇水易出现白斑。所以木蜡油的效果是最好的。耐候性方面木蜡油没有漆膜当然比有漆膜的更胜一筹。
3．从施工角度来讲木蜡油表干，只需2-4小时实干12-24小时，而水性漆需24-48小时才能干燥。而且颜色的选择上木蜡油有几十种现成颜色并且还可以现场再调色表现力非常，丰富色彩上也比水性漆来得更为鲜艳。涂布率也比水性漆高上数倍。